Proyecto: IQ-CT-017

UNIVERSIDAD TECNOLOGICA EQUINOCCIAL

Caracterización de poblaciones de phytophthora infestans en el Ecuador mediante aflp (amplified fragment length polymorphism)

El proyecto fue llevado a cabo para satisfacer una necesidad de mayor conocimiento de la patogenicidad y dinámica poblacional de Phythophttora infestans o tizón tardío de la papa, estuvo dirigido a investigadores en las áreas de patología vegetal, mejoramiento, biotecnología y genética y no precisamente hacia los agricultores de papa. Phytophthora infestans (Mont) de Bary, es el patógeno responsable de la lancha, es un patógeno muy eficaz. Las pérdidas económicas causadas por este organismo se han calculado en 2.750 millones de dólares anuales en los países en desarrollo (Wanda Collins, Centro Internacional de la Papa-CIP, 1999). Se estima que en estos países se invierte hasta 750 millones de dólares en fungicidas para su control (Rebecca Nelson, CIP, 1999). Además, se siguen generando cepas de P. infestans resistentes a los pesticidas.

Estudios poblacionales del patógeno son básicos para desarrollar estrategias de manejo de la enfermedad. Los esfuerzos se han puesto en encontrar resistencia a la lancha en especies silvestres de solanáceas que parecen soportar el ataque de P. infestans, para transferir la resistencia a variedades comerciales. Este tipo de resistencia reduciría en más del 50% la dependencia de pesticidas.

Varios marcadores han sido utilizados para estudiar las poblaciones de P. infestans. A pesar de que el uso de estas técnicas para caracterizar las cuatro poblaciones del patógeno en el Ecuador han dado importantes resultados, aún no se ha encontrado un marcador que logre discriminar entre aislamientos pertenecientes a una misma población pero que muestran una diferenciación a nivel epidemiológico.

Recientemente se ha desarrollado la técnica molecular de AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) la cual permite obtener más marcadores polimórficos por análisis que las técnicas utilizadas previamente.

El objetivo principal del proyecto fue utilizar el marcador molecular neutro AFLP, para la diferenciación de genotipos de P. infestans dentro de cada población del patógeno encontrada en el Ecuador y diferenciarlas epidemiológica y genéticamente.

Se procesaron 150 aislamientos de P. infestans del Ecuador, provenientes de 14 especies de Solanáceas. Un total de 46 bandas generadas por AFLP se identificaron. De éstas, 24 fueron polimórficas. El dendrograma generado por datos de AFLP´s diferencia claramente las 4 poblaciones de P. infestans EC-1, US-1, EC-2.1 y EC-3.

En conclusión, parece existir una especificidad de huésped en EC-1, la población presente en la papa comercial, mientras que US-1 que ataca al tomate riñón puede infectar varios huéspedes alternos: estas consideraciones deberían tomarse en cuenta al diseñar futuros programas de mejoramiento de papa en el Ecuador.

Los resultados se difundieron en los medios especializados nacionales e internacionales, mediante la presentación de un póster en el XX Congreso Latinoamericano de la Papa, ALAP; participación en la Segunda Feria Nacional de la Papa, entrega de afiches a Centros de Investigación, Universidades y ONGs, página WEB de la Universidad Tecnológica Equinoccial, y del CIP.

La colaboración tanto de infraestructura como de asesoría técnica del Centro Internacional de la Papa fue indispensable para llevar a cabo el proyecto.

En cuanto a la sostenibilidad del proyecto, éste mejora la capacidad investigativa de los científicos nacionales e incrementa su experiencia en la estructuración y realización de proyectos de investigación. Con ello, aumenta las posibilidades de apoyo internacional para futuros proyectos de investigación.

El presente proyecto contribuirá de manera decisiva para complementar un laboratorio de uso futuro en las carreras relacionadas al área y en otros proyectos que se están elaborando. Los vínculos que se lograron establecer con otros científicos e instituciones a lo largo de la realización del proyecto también serán de gran ventaja para la Universidad.

Uno de los principales logros de la ejecución del proyecto es la implementación, estandarización y adecuación de la técnica de AFLP para P. infestans en el laboratorio del CIP. Con la adecuación del método alternativo de electroforesis en poliacrilamida, se consiguió desarrollar una técnica que está al alcance de un mayor número de usuarios, se puede obviar el uso de cámaras de secuenciación y fuentes de poder de 4000V que son muy costosas. Quedan sentadas buenas bases para futuros análisis.